Le sous-sol est constitué de la grande plaine sédimentaire du Bassin aquitain. Elle consiste en un empilement de bancs de marnes et de calcaire déposés par la mer lorsque ces terres étaient immergées au Jurassique. Leur pH est neutre ou alcalin.
Lors de l'Orogenèse alpine, cette zone a été soulevée sous l'influence de la naissance des Pyrénées. Les terres sont sorties de l'eau et l'érosion a commencé son œuvre. Elle ramené le sol presque au niveau de la mer et des roches détritiques issues du Massif-Central et des Pyrénées ont été déposées par la Garonne et la Dordogne. Établies en terrasses, ces roches sont bien drainantes et a tendance de pH acide.
Les cépages rouges sont dominés par les membres de la famille des Carmenets. Le cabernet franc N est présent à Bordeaux depuis très longtemps. Le cabernet sauvignon, le merlot N, la carménère N ou le Fer servadou lui sont apparentés. Les autres cépages rouges sont le côt N venu de Cahors ou le petit verdot des Pyrénées.
Ils ont globalement une couleur très sombre et des arômes un peu végétaux. (poivron) L'acidité s'équilibre bien avec l'alcool et la structure tannique.
Les cépages blancs sont essentiellement le sauvignon B et le sémillon B. Le premier est devenu majoritaire voire exclusif dans les vins blancs secs. Le second est le cépage roi des appellations de vins moelleux ou liquoreux. La muscadelle B, le colombard B, le merlot blanc B ou l'ugni blanc B viennent compléter la palette.
Les terroirs du vignoble de Bordeaux se distinguent par leur situation géographique vis-à-vis de la Garonne et de la Gironde (voir carte ci-dessus).
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